Исследователи из нескольких университетов Швейцарии и Университета Корка (Ирландия) обнаружили, как геном SARS-CoV-2 взаимодействует с зараженной клеткой, говорится в сообщении Цюрихского университета. Также они узнали, каким образом химические вещества ингибируют механизм в инфицированных клетках, тем самым значительно уменьшая размножение вирусов.
При отсутствии инфекции рибосома движется вдоль РНК строго заданными шагами, одновременно считывая три «буквы» РНК. Эти три «буквы» определяют соответствующую аминокислоту в синтезируемом белке. Как правило, рибосома работает очень точно и крайне редко бывает, что она скользит вперед или назад на одну или две позиции, а не на три — тогда возникает так называемый «фреймшифтинг», мутация сдвига рамки считывания, рибосома неправильно считывает РНК и производит нерабочие белки.
Некоторые вирусы, в том числе коронавирусы и ВИЧ, в обязательном порядке полагаются на фреймшифтинг, при этом у SARS-Cov-2 его РНК образует необычную и сложную фигуру, что и вызывает эти сбои.
«Используя сложные биохимические эксперименты, исследователи смогли «заморозить» рибосому в месте фреймшифтинга коронавирусной РНК. Затем ученые смогли исследовать этот молекулярный комплекс с помощью криоэлектронной микроскопии», — говорится в сообщении исследователей.
Ученые также провели дальнейшие эксперименты в пробирке и на живых клетках для выяснения того, как этот процесс может быть целенаправленно затронут химическими веществами. Ранее было установлено: несколько химических соединений могут подавлять фреймшифтинг в других коронавирусах. В экспериментах два соединения уменьшили вирусное размножение в 1-10 тыс. раз. Кроме того, используемые вещества не были токсичными для клеток.
Подчеркивается, что эти соединения пока недостаточно эффективны для использования в качестве лекарств, но в перспективе препарат, нацеленный на подавление фреймшифтинга, также может быть полезен для лечения инфекций, вызванных и другими вирусами.